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PCR單管：在樣品量少時使用，可根據樣本數量靈活使用。管身和管蓋相連，易與微量離心管搞混，但不可混用。PCR管管壁較薄，有利于保證PCR擴增中熱傳導的速度和均勻，但也因此無法承受較大的離心力；微量離心管管壁比較厚，滿足離心要求，但也導致了傳熱慢、不均勻。

PCR八連管：在樣本量增大時可選擇八連管。一般有透明和白色雙色可選擇，分別適用于普通PCR和qPCR。

PCR板：PCR板在批量處理樣本時使用，適用性廣，看使用不同自動化應用。板孔邊有數字、字母編碼，便于標記和識別。有透明、彩色透明和白色款，彩色和彩色透明款可用于普通PCR，不同顏色更有助于對樣品進行分類管理；而qPCR實驗建議使用白色款，由于qPCR需要實時定量檢測熒光信號強度，需要更靈敏、精確的熒光信號傳遞，而白色PCR板可以反射熒光信號，減少孔間信號交叉污染，可優化實時熒光定量PCR的結果。