試劑配制和準備
1. DEPC水或RNase free水;
2. 75%乙醇(現配后預冷):用無水乙醇和DEPC水配制(DEPC水:無水乙醇=1:3),然后放4℃備用。1.5mL DEPC水+4.5mL無水乙醇;
3. 異丙/醇:棕色瓶;
4. lv仿:棕色瓶;
5. Trizol:存放于4℃。
RNA抽提
1. 勻漿:在通風櫥中往含有組織塊的EP管中加入TRIzol和磁珠(組織100mg+1ml trizol +2顆研磨珠)。
2. 研磨:設置研磨時間和頻率,一般卵巢組織為65HZ,120s;隨后可以繼續實驗或者凍存在-80℃。
3. 輕柔顛倒混勻10下,室溫孵育5min。
4. 在通風櫥中加入lv仿1/5 trizol體積(0.2ml)。
5. 輕柔顛倒混勻15s,室溫孵育2~3min。
6. 4℃下離心,12000g,15min;觀察液體分層:底層—紅色酚-lv仿相;中間層—粉紅色的交界相;上層—無色液相,即RNA層。
7. RNA分離:用移液槍將上清轉入新的1.5mlEP管中(預估上清的容積,大約500μL,調好移液槍),加入0.5ml(與樣品上清等量)異丙醇,蓋緊后顛倒混勻后室溫靜置10分鐘。
8. 4℃下離心,12000g,15min;小心棄去上清(倒去管中液體,殘留液體用槍頭在管口吸掉液體),注意底部的乳白色沉淀物即為RNA。
9. 往沉淀中加1ml 75%的乙醇(用DEPC水或RNase free水現配,預冷),顛倒混勻洗滌RNA沉淀一次。
10. 4℃下離心,12000g,5min。
11. 用移液槍小心棄去上清(倒去管中液體,殘留液體用槍頭在管口吸掉液體),置于超凈臺上吹干10-15min,讓乙醇揮發。注意:不能太干,肉眼觀察管壁和管底見得到的液體消失后即可,此時RNA沉淀稍變透明。注意不能讓RNA沉淀干燥。勿開紫外;室溫吹干不可太長,RNA易降解。
12. 在管中加10~20ul DEPC水或RNase free水溶解,37℃水浴鍋溫水浴10min,使RNA溶解。
13. 測濃度評估提取的RNA質量:A260/280在1.8-2.0之間;A260/230在2.0左右;A260在0.1-1之間。
14. RNA的保存:提取的RNA保存于-80℃超低溫冰箱中,最好立即反轉錄以cDNA形式保存于-20℃冰箱。