在western Blot過(guò)程中,蛋白Marker雖然是其中小小的一環(huán),但是這個(gè)小細(xì)節(jié)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響不可忽視。Marker在蛋白電泳中的作用主要是用來(lái)指示蛋白條帶所對(duì)應(yīng)的分子量大小,只有標(biāo)準(zhǔn)量精確無(wú)誤,實(shí)驗(yàn)結(jié)果才有說(shuō)服力。此外, Marker還能顯示轉(zhuǎn)膜是否成功以及蛋白在凝膠上的電泳程度的作用。因此選擇正確的蛋白Marker也是western blot實(shí)驗(yàn)成功的必要條件之一。總體來(lái)說(shuō),蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)可以分成未染蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)、預(yù)染蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)二個(gè)級(jí)別。
未染色的蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)
未染色的蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)是zuijiandan,也是最準(zhǔn)確的一種。由于沒(méi)有附帶染料分子或者是標(biāo)記分子,所示大小正好是蛋白原本的大小,是精確判斷蛋白大小必須的。未預(yù)染的Marker可分為寬分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)、高分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)以及低分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)。
① 寬分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)
如果從實(shí)驗(yàn)的整體考慮的,就選擇范圍盡量寬條帶分布比較均勻的,這樣容易判斷你的蛋白在哪個(gè)區(qū)間。不過(guò)蛋白marker條帶越多,每次上樣量也就越費(fèi)。如果買的是大包裝,建議分裝成小體積使用,多次反復(fù)凍融不利于蛋白marker的保存和繼續(xù)使用。
② 高分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)
通常在檢測(cè)大分子量蛋白經(jīng)常使用到高分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)。
③ 低分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)
在一般的蛋白電泳當(dāng)中,更常用的是低蛋白標(biāo)準(zhǔn)分子量,除了有指示蛋白大小的作用以外,有時(shí)還可以用作粗略的定量。特別小的蛋白Marker條帶如果要顯色好,一定要保證足夠的上樣量。
預(yù)染蛋白Marker
預(yù)染蛋白Marker是一些純化好的蛋白混合物,通過(guò)與染料共價(jià)耦聯(lián),在電泳過(guò)程中或者轉(zhuǎn)膜時(shí)可以直接觀察到。預(yù)染蛋白分子量的出現(xiàn)方便了實(shí)驗(yàn),可以幫助我們?cè)陔娪緯r(shí)、電泳后以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測(cè)電泳情況和估計(jì)遷移率。由于預(yù)染蛋白Marker是與染料共價(jià)耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時(shí)遷移特性可能會(huì)發(fā)生某些變化,可能導(dǎo)致一些偏差,所以不太適合精確定位蛋白。不過(guò)多數(shù)情況下Marker的條帶未必能和我們的目標(biāo)蛋白wanquan一樣,我們得到的也不過(guò)是一種相對(duì)Marker指示的參考大小,最后都需要Western來(lái)定性,所以如果不是要區(qū)分大小相近的條帶,預(yù)染Marker還是很好用的,而且也可以和未染色的蛋白標(biāo)準(zhǔn)一起使用。
預(yù)染蛋白標(biāo)準(zhǔn)可以分為兩種:?jiǎn)紊A(yù)染和多色預(yù)染,如果用多色的彩虹Marker跑出來(lái)五顏六色的蛋白條帶,在比較沉悶的電泳實(shí)驗(yàn)中也能增添一抹亮色,此時(shí)在枯燥的實(shí)驗(yàn)過(guò)程中心情也會(huì)愉快一些吧!